Ekologisen kompensaation avulla ihmisen toiminnasta luonnon monimuotoisuudelle yhtäällä aiheutunut haitta (esim. rakentamisesta) hyvitetään lisäämällä luonnon monimuotoisuutta toisaalla. Ekologista kompensaatiota käytetään vain, jos muita keinoja haittojen estämiseksi tai lieventämiseksi ei ole käytettävissä.